Suun levyepiteelikarsinooma (oral squamous cell carcinoma, OSCC) on yleisin suusyövän histologinen alatyyppi. Maailmanlaajuisesti OSCC:n merkittävimmät riskitekijät ovat tupakointi, runsas alkoholinkäyttö ja areca-pähkinästä valmistetun purutupakan pureskelu.
Myös huono suuhygienia on tunnettu riskitekijä. Tietyt mikrobit, kuten Porphyromonas gingivalis ja Candida-suvun hiivat, on aiemmissa tutkimuksissa yhdistetty OSCC:n kehittymiseen ja ilmenemiseen.
Suun mikrobiomitutkimukset ovat kasvattaneet suosiotaan nykyaikaisten sekvensointimenetelmien yleistyttyä. Aiemmat OSCC-potilaiden suun mikrobiomitutkimukset ovat keskittyneet joko bakteereihin (bakteriomi) tai hiivoihin (mykobiomi), ja otannat ovat olleet pieniä. OSCC-potilaiden syljen mikrobiologinen kokonaiskuva on kuitenkin ollut epäselvä.
Väitöstyön tavoite oli tutkia OSCC-potilaiden syljen hiivoja ja bakteereita ennen syöpähoitoja ja hoitojen jälkeisenä seuranta-aikana. Löydöksiä verrattiin ikä- ja sukupuolijakaumaltaan samanlaiseen verrokkiryhmään, jolla ei ollut syöpää. Parafiinistimuloitua sylkeä kerättiin vuosien 2011 ja 2014 välillä sadalta suusyöpäpotilaalta. Seurantanäytteet otettiin vuosien 2016 ja 2017 välillä 44 hoidetulta potilaalta. Lisäksi näytteet kerättiin 103 verrokilta. Osatöissä 1 ja 2 Candida-hiivojen yleisyyttä tutkittiin viljelymenetelmin. Osatöissä 3 ja 4 bakteeri- ja mykobiomiprofiileja tutkittiin 16S rRNA -geenin ja ITS2 (Internal Transcribed Spacer region 2) -alueen rinnakkaissekvensoinnilla Academic Centre for Dentistry Amsterdamissa (ACTA).
Tutkimuksissa havaittiin, että OSCC-potilaiden syljen bakteeri- ja mykobiomiprofiilit erosivat verrokkien profiileista tilastollisesti merkitsevästi. Potilaiden bakteeriprofiilit muuttuivat syöpähoitojen jälkeisenä seuranta-aikana, mutta mykobiomiprofiilissa merkitsevää muutosta ei tapahtunut. Potilaiden mykobiomiprofiili oli Candida-voittoinen, ja näytteiden sisäinen monimuotoisuus oli kaventunut verrokkeihin verrattuna. Syljen Candida-löydös ei liittynyt potilaiden lisääntyneeseen kuolleisuuteen, eikä erilaisilla hoitopoluilla ollut vaikutusta Candida-hiivojen esiintyvyyteen. Seurantanäytteissä korostui happoa tuottavien bakteerien kohonnut osuus verrattuna hoitoa edeltäviin ja verrokkien näytteisiin.
Salivary microbiome of oral cancer patients
Anna Mäkinen
HLT
VASTAVÄITTÄJÄ
Michael Curtis, professori
King’s College London, Iso-Britannia
KUSTOS
Antti Mäkitie, professori
Helsingin yliopisto
ESITARKASTAJAT
Elisabeth Bloemena,
professori emeritus
Amsterdam UMC, ACTA, Vrije Universiteit Amsterdam, Alankomaat
Karin Garming Legert, apulaisprofessori
Karolinska Institutet, Ruotsi
OHJAAJAT
Jukka H. Meurman,
professori emeritus
Helsingin yliopisto
Antti Mäkitie, professori
Helsingin yliopisto
Verkkojulkaisun osoite: https://helka.helsinki.fi/permalink/358UOH_INST/q5v72t/alma9934671894006253