Tiettyjen bakteerien läsnäolo suussa altistaa kariekselle (erityisesti Streptococcus mutans) ja parodontiitille (erityisesti Porphyromonas gingivalis, Tannerella forsythia ja Treponema denticola). Lukuisia bakteerilajeja on tunnistettu myös liittyen endodonttisiin sairauksiin.
