Mikrobeja ajatellaan usein taudinaiheuttajina, mutta niiden rooli on merkittävä myös terveyden ylläpitäjänä, niin suussa kuin muuallakin elimistössä. Terveyttä ylläpitävän – tai sairauksille altistavan − mikrobiomin kehittyminen alkaa jo varhaislapsuudessa.